Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MestQ07646 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MestQ07646 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms