Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms