Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah1bQ06985 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms