Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Sh3bp2Q06649 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp2Q06649 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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