Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms