Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms