Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GscQ02591 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GscQ02591 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms