Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms