Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms