Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Top2aQ01320 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top2aQ01320 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms