Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjb2Q00977 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms