Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smn1P97801 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smn1P97801 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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