Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp4cP97470 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp4cP97470 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms