Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H3f3aP84244 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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