Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tubg1P83887 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms