Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb2P81069 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms