Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms