Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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