Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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