Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Msx3P70354 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Msx3P70354 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msx3P70354 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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