Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms