Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rpl8P62918 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl8P62918 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms