Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms