Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snrpd1P62315 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snrpd1P62315 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Snrpd1P62315 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Snrpd1P62315 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Snrpd1P62315 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Snrpd1P62315 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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