Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CgnP59242 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CgnP59242 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CgnP59242 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms