Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms