Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ctdsp1P58466 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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