Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms