Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp25P57080 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp25P57080 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp25P57080 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp25P57080 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp25P57080 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp25P57080 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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