Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmoP56726 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmoP56726 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms