Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp2c40P56657 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms