Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms