Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Atp5eP56382 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Atp5eP56382 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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