Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab4aP56371 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms