Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtswP56203 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtswP56203 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtswP56203 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms