Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Defa6P50704 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
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Defa6P50704 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa6P50704 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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