Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfaP48030 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms