Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrprbP47758 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SrprbP47758 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms