Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab11bP46638 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab11bP46638 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms