Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms