Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VhlP40338 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VhlP40338 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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