Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cap1P40124 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cap1P40124 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cap1P40124 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cap1P40124 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cap1P40124 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cap1P40124 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cap1P40124 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cap1P40124 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms