Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms