Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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