Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ptk2P34152 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ptk2P34152 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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