Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nedd1P33215 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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