Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PvalbP32848 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PvalbP32848 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms