Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SsbP32067 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SsbP32067 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SsbP32067 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SsbP32067 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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