Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxc11P31313 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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