Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd28P31041 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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